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O teste genômico é um tipo de teste que examina mais do que apenas seus genes, mas as maneiras pelas quais seus genes interagem e o que essas interações significam para sua saúde.O teste genômico é frequentemente confundido com o teste genético. A principal diferença é que os testes genéticos são projetados para detectar uma única mutação genética (como as mutações BRCA1 e BRCA2 associadas ao câncer de mama e ovário), enquanto os testes genômicos examinam todos os seus genes.
Ao dar uma olhada mais ampla em sua composição genética, incluindo como seus genes são sequenciados e como eles influenciam uns aos outros, os testes genômicos podem oferecer insights sobre como seu corpo funciona em um nível molecular e o que isso significa em termos de risco de doença, progressão ou recorrência.
O teste genômico é comumente usado no tratamento do câncer para determinar como um tumor provavelmente se comportará. Isso pode ajudar os médicos a prever o quão agressivo o seu câncer será e se ele tem probabilidade de se espalhar (formar metástases) para outras partes do corpo.
O teste genômico é uma ferramenta central no desenvolvimento da medicina personalizada que visa personalizar tratamentos, produtos e práticas para o indivíduo.
Genética vs. Genômica
Embora a genética e a genômica estejam associadas aos genes, elas têm objetivos e aplicações totalmente diferentes.
Genética
Genética é o estudo dos efeitos que os genes têm em um indivíduo. Os genes fornecem ao corpo instruções sobre como produzir proteínas; as proteínas, por sua vez, determinam a estrutura e a função de cada célula do corpo.Os genes são constituídos por blocos de construção, chamados DNA, que são organizados em uma cadeia chamada "bases". A ordem, ou sequenciamento, das bases determinará quais instruções serão enviadas e quando.
Enquanto muitos genes são codificados para produzir proteínas específicas, outros genes não codificados regulam como e quando as proteínas são produzidas (essencialmente ligando e desligando certos genes). Qualquer aberração na forma como um gene funciona pode influenciar o risco de certas doenças, dependendo de quais proteínas são afetadas.
Em alguns casos, uma única mutação de gene pode conferir a doenças como fibrose cística, distrofia muscular e doença falciforme.
Os testes genéticos podem procurar qualquer mutação genética que você possa ter herdado de seus pais, seja para confirmar um diagnóstico, prever risco futuro ou identificar se você é portador.
Genômica
Genômica é o estudo da estrutura, função, mapeamento e evolução do conjunto completo de DNA, incluindo todos os genes. O material genético mais todas as sequências são chamados de genoma. O objetivo da genômica é analisar a função e a estrutura de um genoma para:
- Entenda como sistemas biológicos complexos, como o sistema cardiovascular e o sistema endócrino (hormônio), influenciam um ao outro
- Prever quais problemas podem ocorrer se as interações genéticas interferirem nas funções biológicas normais
Ao todo, existem entre 20.000 a 25.000 genes codificadores de proteínas diferentes e cerca de 2.000 genes reguladores não codificados no genoma humano.
A genômica é importante porque nos ajuda a entender por que algumas pessoas são geneticamente predispostas a certas doenças (mesmo que não entendamos como certos genes interagem). Em vez de identificar uma única via genética, a genômica avalia a infinidade de variáveis genéticas que afetam o desenvolvimento e / ou tratamento de uma doença, como câncer ou diabetes.
Ao contrário da genética, a genômica não se restringe a mutações hereditárias. Ele identifica como sua composição genética influencia o curso de uma doença e, inversamente, como o ambiente, o estilo de vida e os tratamentos com medicamentos podem desencadear mutações que alteram esse curso.
Ao compreender essas variáveis em constante mudança, os médicos podem fazer escolhas mais informadas no tratamento, muitas vezes preventivamente.
Papel dos testes genômicos
O teste genômico é baseado em nossa compreensão atual do genoma humano, um processo que começou com o Projeto Genoma Humano colaborativo de 1990 a 2003.
Nos anos seguintes, os cientistas têm sido capazes de identificar cada vez mais quais anomalias genéticas se traduzem não apenas no desenvolvimento de uma doença, mas também nas características da doença. Isso forneceu insights sobre por que algumas pessoas desenvolvem formas mais agressivas de câncer, vivem mais com o HIV ou deixam de responder a certas formas de quimioterapia.
Embora os testes genéticos possam confirmar ou descartar uma condição genética suspeita, a genômica leva os testes um passo adiante, fornecendo-nos:
- Marcadores de risco a fim de rastrear doenças
- Marcadores prognósticos para prever a rapidez com que uma doença irá progredir, a probabilidade de recorrência e o resultado provável de uma doença
- Marcadores preditivos para orientar as escolhas de tratamento e evitar toxicidade
- Marcadores de resposta para determinar a eficácia de vários tratamentos
Embora a genômica se concentre nas implicações de nossa composição genética, independentemente de todos os outros fatores, ela não é usada isoladamente.
O movimento crescente em direção à medicina personalizada está mudando a forma como abordamos as doenças em geral. Em vez de uma solução única para todos, a medicina personalizada leva em consideração a alta variabilidade na genética, no meio ambiente e no estilo de vida para oferecer uma solução mais personalizada para cada indivíduo.
Como funciona o teste
Os testes genômicos são normalmente oferecidos como um painel de genes direcionados, variando de uma análise de "pontos críticos" genéticos (locais bem estabelecidos de mutação) até o sequenciamento completo do gene. Os testes são normalmente realizados em um laboratório especializado certificado pelo Clinical Laboratory Improvement Amendments (CLIA) de 1988. Hoje, existem mais de 500 laboratórios de genética certificados pelo CLIA nos Estados Unidos.
A maioria dos testes requer uma amostra de sangue ou saliva ou um esfregaço da parte interna da bochecha (conhecido como esfregaço bucal). Dependendo dos objetivos do teste, pode ser necessário apenas algumas gotas de sangue ou vários frascos. Uma biópsia de um tumor ou medula óssea pode ser necessária para pessoas com câncer.
Uma vez obtida a amostra, geralmente leva de uma a quatro semanas para receber os resultados. Dependendo da condição a ser tratada, um conselheiro genético pode estar disponível para ajudá-lo a entender as limitações do teste e o que os resultados significam e não significam.
Sequenciamento de próxima geração
O sequenciamento de última geração (NGS) é a principal ferramenta para testes genômicos. É usado para identificar e avaliar a sequência genética de milhões de segmentos curtos de DNA chamados "leituras". As leituras são então montadas em uma sequência completa para determinar quais variações genéticas (variantes) estão presentes e o que significam.
O NGS é extremamente flexível e pode ser usado para sequenciar apenas alguns genes, como para um painel de câncer de mama hereditário, ou todo o genoma usado normalmente para fins de pesquisa para rastrear doenças raras.
Uma vez que a maioria das variantes tem pouco ou nenhum impacto conhecido na saúde humana, elas serão filtradas para identificar as poucas que são clinicamente significativas. Essas variantes serão pontuadas em uma escala de cinco pontos variando de:
- Benigno (não causador de doenças)
- Provavelmente benigno
- Incerto
- Provavelmente patogênico (causador de doenças)
- Patogênico
Enquanto a maioria dos laboratórios relatam os achados patogênicos e prováveis, alguns também incluem os achados incertos, provavelmente benignos e benignos. Uma interpretação de um geneticista certificado também seria incluída.
Resultados primários e secundários
Os resultados diretamente relacionados a uma condição suspeita são referidos como resultados primários, enquanto aqueles que são clinicamente significativos, mas não relacionados, são chamados de resultados secundários (ou incidentais).
Achados secundários são frequentemente relevantes e podem revelar o risco genético de uma doença futura, o status de portador ou achados farmacogenéticos (como seu corpo processa uma droga específica). Em alguns casos, o teste também pode ser realizado em seus pais para ajudar a identificar quais variantes são compartilhadas e quais são de novo (não herdado).
Teste genômico em câncer
O desenvolvimento dos testes genômicos ocorreu mais ou menos em conjunto com o aumento das terapias direcionadas ao câncer. Conforme os cientistas começaram a entender como certas variantes genéticas transformaram células normais em cancerosas, eles foram capazes de desenvolver testes para rastrear variantes específicas e desenvolver drogas para direcionar esses genes.
Hoje, o teste genômico se tornou uma parte cada vez mais integrante do tratamento e gerenciamento de muitos tipos diferentes de câncer, incluindo câncer de mama e de pulmão.
Embora os testes genéticos possam ajudar a identificar o risco de câncer de uma pessoa, o teste genômico nos ajuda a identificar os marcadores genéticos associados às características da doença. Permite-nos prever o comportamento provável de um tumor, incluindo a velocidade com que irá crescer e a probabilidade de metástase.
Isso é importante, uma vez que as células de um tumor estão sujeitas a mutações rápidas. Mesmo que uma única variante genética seja responsável pelo surgimento de um tumor, a própria doença pode tomar muitos cursos diferentes, alguns agressivos e outros não. Embora um teste genético possa ajudar a identificar a malignidade, um teste genômico pode identificar as formas mais eficazes de tratá-la.
Além disso, se um tumor sofre mutação repentina, um teste genômico pode detectar se a mutação é receptiva à terapia direcionada. Um exemplo é o medicamento Nerlynx (neratinibe) usado para direcionar e tratar o câncer de mama HER2-positivo em estágio inicial.
Comparação de testes genéticos e genômicos em câncer de mama
GenéticaO estudo de características genéticas herdadas, incluindo aquelas associadas a certas doenças
A genética estabelece o risco de herdar o câncer de seus pais
O teste BRCA1 e BRCA2 pode prever o risco de contrair câncer de mama ou de ovário
Depois de saber o seu risco de câncer de mama, você pode tomar medidas para reduzir ativamente seu risco
O estudo da atividade e interação dos genes no genoma, incluindo o seu papel em certas doenças
Depois que você tem câncer, a genômica estabelece como o tumor se comportará
Os testes de câncer de mama Oncotype DX e PAM50 são usados para traçar o perfil de um tumor e prever como você responderá à quimioterapia
Com base nos resultados do teste genômico, você e seu médico podem decidir quais opções de tratamento são mais adequadas após a cirurgia
Teste genômico doméstico
O teste genômico doméstico já se infiltrou em nossa vida cotidiana, começando em grande parte com o lançamento do kit genético doméstico 23andMe direto ao consumidor em 2007.
Enquanto alguns testes genéticos domésticos, como os testes AncestryDNA e National Geographic Geno 2.0, foram projetados exclusivamente para rastrear a ancestralidade de uma pessoa, o 23andMe ofereceu aos consumidores a chance de identificar seu risco de certos distúrbios genéticos de saúde.
É um modelo de negócios repleto de desafios. Em 2010, a Food and Drug Administration (FDA) dos EUA ordenou que a 23andMe e outros fabricantes de testes genéticos domésticos relacionados à saúde parassem de vender os dispositivos, que o regulador considerou como "dispositivos médicos" segundo a lei federal.
Em abril de 2016, após anos de negociação com o FDA, 23andMe recebeu o direito de liberar seu teste de risco de saúde genético do serviço de genoma pessoal, que é capaz de fornecer informações sobre a predisposição de uma pessoa para as 10 doenças a seguir:
- Deficiência de alfa-1 antitripsina (um distúrbio genético ligado a doenças pulmonares e hepáticas)
- Doença celíaca
- Distonia primária de início precoce (um distúrbio involuntário do movimento)
- Deficiência de fator XI (um distúrbio de coagulação do sangue)
- Doença de Gaucher tipo 1
- Deficiência de glicose-6-fosfato desidrogenase (um distúrbio de glóbulos vermelhos)
- Hemocromatose hereditária (um distúrbio de sobrecarga de ferro)
- Trombofilia hereditária (um distúrbio de coagulação do sangue)
- Doença de Alzheimer de início tardio
- Mal de Parkinson
Os testes baseados na saliva oferecem o mesmo nível de precisão que os usados pelos médicos.
Apesar das vantagens desses produtos, persistem preocupações entre alguns defensores quanto ao risco potencial de discriminação caso a informação genética seja compartilhada sem a autorização do consumidor. Alguns apontam para o fato de que a gigante farmacêutica GlaxoSmithKline (GSK) já é um investidor na 23andMe e planeja usar os resultados dos testes de mais de cinco milhões de clientes para desenvolver novos medicamentos.
Para rebater as críticas, a 23andMe avisou a FDA que os resultados seriam "desidentificados", o que significa que a identidade e as informações do consumidor não seriam compartilhadas com a GSK.